Antiga illa poblada des del s. IX-VIIIa.C (bronze final). Al s. VI a.C, comercia amb fenicis, púnics i foceus massallotes. Apareix el nom d’Emporiom com a mercat a la fi d’aquest segle.

Posteriorment la població autòctona (íbers indiquetes) i de mercaders grecofoceus s’instal.la en terra ferma i neix el gran port d’Empúries, que abastaria com a ports subsidiaris, el s. II el de l’Escala i la Clota. Amb un poblament ininterromput fins a l’actualitat, conserva la muralla medieval sobre restes de la ciclòpia grega, l’església dedicada a Sant Martí del 1538 (sembla que va ser edificada sobre restes d’un antic temple dedicat a Artemisa d’Efes).

Seu de la primera capital del comtat d’Empúries fins al 1064. Prop de l’entrada del Fortí (NO), l’escriptora Víctor Català hi va fer un jardi (c. de la Francesca, 7).